En
1880 se decretó la federalización de Buenos Aires y
el 19 de Noviembre de 1882 fue fundada la ciudad de La Plata con jerarquía
de capital de provincia. El Poder Ejecutivo Bonaerense dispuso el
traslado de las colecciones de Moreno a la nueva ciudad, hecho que
se concretó en junio de 1884. En octubre de ese mismo año
se dio comienzo a la construcción del edificio del Museo
de La Plata, encargándose la dirección de las obras
a los arquitectos europeos Heynemann y Åberg.
El
edificio se terminó en 1889, tiempo súmamente breve
considerando su envergadura, aunque sus puertas se abrieron al público
oficialmente el 19 de noviembre de 1888.
En
1906, al fundarse la Universidad Nacional de La Plata, el Museo
pasó a formar parte de la misma, incorporándole nuevas
actividades: la investigación y la enseñanza superior
de las Ciencias Naturales.